Την συζήτηση για τον διαχωρισμό κράτους εκκλησίας πυροδότησε ο θόρυβος που έγινε για το μάθημα των θρησκευτικών το οποίο μάλιστα έγινε αφορμή για έντονη αντιπαράθεση μεταξύ ΚΚΕ και αρχιεπισκόπου μετά την τοποθέτηση του κυρίου Ιερώνυμου
Ο διαχωρισμός κράτους εκκλησίας είναι ένα μεγάλο κεφάλαιο που θα πρέπει να ανοίξει ωστόσο η κυβέρνηση δεν το ανοίγει με τον σωστό τρόπο εκτός κι αν δεν θέλει τονίζει το ΚΚΕ μετά και τα όσα διημείφθησαν για την διδασκαλία του μαθήματος των θρησκευτικών που μάλιστα έφεραν σε οξεία αντιπαράθεση το κόμμα με τον αρχιεπίσκοπο.
Υπενθυμίζεται πως ο αρχιεπίσκοπος Ιερώνυμος, κατά την εισήγησή του στην Ιερά Σύνοδο, τάχθηκε κατά του διαχωρισμού Κράτους – Εκκλησίας, τονίζοντας ωστόσο πως αν το επιχειρήσει η κυβέρνηση να το επιβάλει μονομερώς τότε «ο ευλαβής ελληνικός λαός θα δώσει οριστική απάντηση». Όπως είπε επιδιώκεται ο χωρισμός της Εκκλησίας από τον λαό της, ενώ παράλληλα προκάλεσε την Πολιτεία να επιχειρήσει διαχωρισμό «αν έχει τη συγκατάθεση αυτού του λαού». Ωστόσο ο αρχιεπίσκοπος της Ελλάδας προχώρησε σε αναδίπλωση μετά την θύελλα που ξέσπασε από την γνωστή τοποθέτησή του που προκάλεσε την μήνη του ΚΚΕ ενώ αξίζει να σημειώσουμε πως στο πλευρό του κυρίου Φίλη, διαχωρίζοντας τη θέση του από τις ακραίες εκφράσεις και τοποθετήσεις τάχθηκε ο Μητροπολίτης Διδυμοτείχου.